阴道内存在着种类繁多的阴道菌群，包括细菌、支原体、病毒、原虫、白色假丝酵母菌等，它们与人体、外部环境之间构成了相互制约、相互协调、动态平衡的阴道微生态系统。
健康的阴道内，以乳杆菌为主，乳杆菌产生的乳酸，可以维持阴道内正常的酸性环境，并形成保护膜，防止微生物入侵和定植。同时乳杆菌产生的过氧化氢可杀灭入侵的致病菌。
当因为各种原因导致乳杆菌数量减少、菌群失调、生化指标发生改变，阴道微生态环境平衡遭到破坏，从而引起各类阴道炎症的发生，而阴道炎症又能加重阴道菌群失调，进入恶性循环。
影响正常阴道微生态系统的因素
- 阴道损伤，包括分娩、手术及外力等；
- 微生物菌群失调，包括阴道不当冲洗、滥用抗生素及感染性传播疾病等导致；
- 免疫功能低下，包括全身性疾病、免疫功能低下（比如劳累、压力大、激素影响、因其他疾病原因使用免疫抑制剂、抗肿瘤药物等）导致病原体趁虚而入；
- 内分泌失调，包括月经期、妊娠期、哺乳期、绝经期等激素波动的影响。
大部分阴道微生态失调是暂时状态，机体抵抗力好转即可自行恢复正常。但是当外来病原菌增加或机体抵抗力下降时，就会很容易出现阴道炎、细菌性阴道病等妇科炎症。因此，为了维持正常的阴道微生态环境，就要注意避免上述各种不良因素的影响；如果某些不良因素实在无法避免而导致阴道微生态失调时，可以采取以下措施维持微生态环境的稳定。
恢复阴道正常微生态环境的措施
药物治疗有效杀灭各种病原体后，要注意恢复和重建阴道微生态环境，防止反复感染。可在专科医生的指导下采取以下措施恢复阴道微生态环境：
另外，微生态环境改变和 HPV 感染、宫颈癌前病变有相关性
阴道炎症会导致菌群失调和阴道微生态环境破坏，pH 值升高，而阴道微生态破坏会增加 HPV 感染的机会。特别是细菌性阴道病患者的阴道分泌物，如丙酸和丁酸等，能破坏上皮细胞，增加 HPV 易感性。
而且，乳杆菌有抗感染和抗肿瘤的作用。而阴道菌群改变的患者的阴道乳杆菌含量减少，乳杆菌在阴道黏膜上定植数量就会减少，各种病原体感染增加，导致阴道微生态严重失衡，从而增加宫颈上皮细胞异常增生与恶变、发展成为宫颈上皮内瘤变（CIN）及宫颈癌的风险。
由此可见，阴道微生态失衡、乳酸杆菌的减少与阴道炎、细菌性阴道病、HPV 感染、CIN 及宫颈癌密切相关。因此，阴道炎症的及早和正确诊治对于宫颈癌的防治也意义重大。